Politička karijera Krešimira Zubaka počela je još 1980, kada je imenovan za zamjenika ministra pravde tadašnje SRBiH. Nastavljena je nakon njegovog povratka iz izbjeglištva u Hrvatskoj, 1993. godine, kada je imenovan za ministra pravosuđa u vladi Hrvatske republike Herceg-Bosne. Predsjednikom ove paradržavne tvorevine tokom rata u BiH postao je po okončanju sukoba između HVO-a i Armije RBiH 1994, a dva mjeseca nakon preuzimanja ove dužnosti biva imenovan i za prvog predsjednika novoosnovane Federacije BiH, koja će Dejtonskim sporazumom biti definisana kao jedan od dva entiteta u našoj zemlji. Najvišu dužnost u državi, člana Predsjedništva BiH, obavljao je nakon prvih poslijeratnih izbora u našoj zemlji 1996. godine, a društvo su mu pravili Alija Izetbegović i Momčilo Krajišnik. Nakon razlaza sa dotadašnjom strankom HDZBiH osniva Novu hrvatsku inicijativu, koja je bila dio vladajuće koalicije Alijanse za promjene, od 2000. do 2002. U to vrijeme je bio ministar za ljudska prava i izbjeglice BiH, što mu je i posljednja politička funkcija koju je do sada obavljao.
Na pitanje novinara kako gleda na politiku Dragana Čovića i HDZ-a BiH i koliko koristi od toga ima hrvatski narod u BiH, Zubak je odgovorio:
„Ako govorimo o aktuelnoj situaciji, politika koju on vodi za mene je apsolutno neprihvatljiva. Politika koju on sad vodi po meni je apsolutno pogrešna i suprotna je interesima Hrvata koji žive u BiH. Zapravo, suprotna je interesima svih koji žive u BiH, a Hrvata posebno. Pogrešno je blokirati uspostavu vlasti na sve moguće načine, pa i ako hoćete donošenjem lažnih odluka, uz ultimatume da se prvo moraju rješavati neka druga pitanja prije onih aktuelnih i gorućih. (…) Imam dojam da je on HDZ stavio u poziciju instrumenta Dodikove politike. Mislim da je to pogrešno. Možda Dodik i ima razloga da se ovako ponaša. On to i može raditi, jer u RS-u vlast kako-tako funkcionira. Što se tiče Hrvata, mi nemamo nikakve instrumente i nama uopće ne odgovara ovakvo nedefinirano stanje, u kojem institucije ne funkcioniraju. To samo šteti nama. Međutim, to je njegov i izbor stranke koju vodi“.
(TBT)